L’ACMS compte environ 1 000 collaborateurs. Plus de 60% de l'effectif est constitué de médecins du travail et de secrétaires médicales ; les infirmières, assistantes sociales, responsables administratives, assistantes en santé au travail et IPRP sont également très présents. D’autres personnels participent à la qualité des prestations dans les centres mobiles ou au siège (services adhérents, administratifs, techniques ou encore informatiques…).
Au 31 décembre 2011, les effectifs de l’ACMS étaient les suivants :